l’ADN environnemental amliore le suivi de la diversit des poissons


La biodiversit des rcifs coralliens s’avre plus importante en laboratoire qu’ l’il nu. Une quipe internationale de chercheurs, mene par une cohorte de scientifiques franais notamment du CNRS et de l’Ifremer, en atteste dans une tude, publie ce 20avril, dans la revue Proceedings of the Royal Society Biological Sciences. Pour mieux contrler la diversit actuelle des poissons rcifaux connus, particulirement sensibles au changement climatique, les chercheurs se sont appuys sur le squenage d’ADN environnemental (ADNe) plutt que sur l’observation visuelle en plonge.

Pendant deux ans, ils ont rcolt 226chantillons dans cinq rgions ocaniques tropicales: aux Carabes, dans le Triangle de corail, dans l’ouest de l’ocan Indien ainsi que dans le Pacifique central et sud-ouest. Ils ont ensuite squenc et ainsi identifi les traces d’ADN de 2650espces, soit une diversit suprieure de 16% (ou de 25% en termes de familles) celle mesure en moyenne par le programme de surveillance Reef Life Survey de la fondation australienne ponyme depuis treize ans.

Cette diffrence s’explique par l’apparente absence de petites espces benthiques (vivant proches du fond marin), qui constituent la moiti de la diversit en poissons rcifaux, lors d’observations et comptages visuels. Parmi les espces plagiques (rparties dans la colonne d’eau) dtectes par l’ADNe, beaucoup sont des espces ocaniques ou des eaux profondes, ou appartiennent aux familles qui vitent les plongeurs, voire ne rsident pas de manire permanente dans les rcifs coralliens, comme les Scombrids (famille des maquereaux et des thons) et les Carcharhinids (comportant le requin-corail, le requin-tigre ou encore le requin-citron), remarquent les chercheurs. La dtection de ces espces transitoires est primordiale du fait de leur participation active et srement sous-estime au fonctionnement du rcif, par le biais des stades larvaires plagiques ou des migrations nocturnes vers le rcif. De plus, une partie importante de l’ADNe filtr頻 n’a pas pu tre identifi ou assign des espces connues, compte tenu de probables lacunes dans les bases de donnes de rfrence.




Article publi le 21 avril 2022



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